儿科是集治疗、保健、预防、教学为一体的综合性科室,是我市重点学科，科室分为普通儿科、新生儿科、儿童保健科。
实际开放床位69张（普通病房床位49张，新生儿病房床位20张）。共有医护人员43人，其中主任医师2名、副主任医师2名、主治医师5名、其中主管护师15名，均为本科及以上学历。科室抢救、治疗、监护设备齐全，拥有AKR-938抢救台、YP-90A2、YP-2008型温箱、YP-100C型光疗婴儿培养箱、XH2蓝光治疗仪、纽邦 2000呼吸机、SLE呼吸机、CPAP治疗仪、MP-900F心电监护仪、婴幼儿高压氧舱、微量注射泵、专用吸痰机等设备。科室重视人才培养，多次派遣医护人员去上级医院（北京儿童医院、山东省立医院、青岛大学附属医院、烟台毓璜顶医院）进修学习，并长期与上级医院保持着密切的业务联系，为山东省立医院儿科联盟单位。
技术特色：
普通儿科：除开展儿科常见病及多发病的诊疗、抢救外，对慢性咳嗽、重症肺炎、川崎病、过敏性紫癜等疾病治疗有独到之处。
新生儿科：是我院特色科室之一，治疗水平在菏泽市处于领先地位，对极早早产儿、新生儿重度窒息、新生儿肺出血、新生儿胎粪吸入综合症等疾病治愈率高。
儿童保健科：目前开展新生儿NBNA筛查，0-6岁儿心量表筛查，婴幼儿保健体检、发育评估、高危儿、体弱儿定期追踪，高压氧治疗及康复按摩等项目，研究儿童生长发育的规律及其影响因素，不断提高儿童在体格、智力和社会适应性方面的生长发育水平，研究各种疾病的预防措施，包括免疫接种、先天性遗传性疾病的筛查、科学知识普及教育等，研究儿童中各种疾病患儿的康复可能性以及具体方法，尽可能地帮助这些儿童提高他们的生活质量乃至完全恢复健康。
